SCI-INFO
SCI-INFO
База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Число соавторов публикации - 5
Целевой показатель госзадания:
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в WEB of Science (WoS) - Q4 - Формула: 10/корень квадратный из Nавторов = 10/корень квадратный из 5 (2.2361) = 4.47
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в SCOPUS - Q3 - Формула: 8/корень квадратный из Nавторов = 8/корень квадратный из 5 (2.2361) = 3.58
Количество соавторов публикации - 5
Публикация в изданиях из Белого списка уровень: 3, K=5
  • Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(5*1) = 1
  • Осипова А. С.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(5*1) = 1
  • Улупова Ю. Н.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(5*1) = 1
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(5*1) = 1
Статья в периодическом издании

Effects of Various Factors on Transcription Activity of pogo Transposons in Oyster Crassostrea gigas

WoS 1.200/Q4 SCOPUS 0.331/Q3 БС 3
DOI https://doi.org/10.1134/S0026893325700141
Язык Английский
Журнал Molecular Biology

ISSN: 0026-8933; Онлайн ISSN: 1608-3245
Год 2025
Выходные данные том: 59; номер: 4; страницы: 494-507
Авторы
  1. Пузакова Л. В. (Puzakova L. V.)
  2. Кохан А. С. (Osipova A. S.)
  3. Улупова Ю. Н. (Ulupova Yu. N.)
  4. Пузаков М. В. (Puzakov M. V.)
  5. Puzakova P. M.
    Sevastopol Branch, Moscow State University, Sevastopol, 299001 Russia (ru)
Даты Поступила в редакцию: 17.10.2024
После доработки: 28.01.2025
Принята к публикации: 05.02.2025
Опубликована: 06.08.2025
Абстракт The pogo superfamily is one of the most common groups of DNA transposons. Ten pogo transposons are known to occur in the genome of the Pacific oyster Crassostrea (Magallana) gigas (Thunberg, 1793). The oyster pogo elements were shown to belong predominantly to three families: pogoR, Passer, and Fot. A genome analysis in five oysters detected nine pogo elements in each oyster, while one element (Mariner-38_CGi) was found in only two genome assemblies. The genome assemblies differed in the copy number and lengths of the pogo transposons and the presence and lengths of inverted repeats. Data on the evolutionary dynamics of the pogo transposons and their low copy number in individual genomes suggested their low activity throughout the life cycle. A transcriptional activity analysis showed that the Mariner-30_CGi and Mariner-34_CGi elements were expressed permanently or in a condition-dependent manner in more than half of the cases. Transcriptional activities of five elements were found to depend on the developmental stage. It was assumed that the elements could have been domesticated by the oyster genome. The study expands the understanding of evolution of the pogo transposons and their role in animal genome diversification.
Ключевые слова: DNA transposons, pogo, genome evolution, intraspecific diversity, molecular domestication
Сведения о финансировании, указанные в публикации This work was supported by the Russian Science Foundation (project no. 23-26-00154, https://rscf.ru/project/23-26-00154/, 2023–2024, “DNA Transposons IS630/Tc1/mariner of the Pacific Oyster Crassostrea gigas: Contribution to Genetic Instability and Effect on Genetic Diversity”).
URL https://link.springer.com/article/10.1134/S0026893325700141
Дополнительные сведения
IBSS 155

Запись создана: 12-08-2025 13:29
Последнее изменение: 01-09-2025 09:42

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Puzakova L. V., Osipova A. S., Ulupova Yu. N., Puzakov M. V., Puzakova P. M. Effects of Various Factors on Transcription Activity of pogo Transposons in Oyster Crassostrea gigas // Molecular Biology. 2025. Vol. 59, no. 4. P. 494-507. https://doi.org/10.1134/S0026893325700141
[WoS 1.200/Q4][SCOPUS 0.331/Q3][БС 3]
Экспертное заключение: № 59, 2025
Белый список
Уровень БС
3
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.200/Q4 (2024)
Идентификатор
001546082800005
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.331/Q3 (2024)
Идентификатор
2-s2.0-105012776145
РИНЦ
Статус
Нет
ID
82715030
EDN
SSYWZJ