База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Число соавторов публикации - 2
Целевой показатель госзадания:
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в SCOPUS - Q4 - Формула: 6/корень квадратный из Nавторов = 6/корень квадратный из 2 (1.4142) = 4.24
Количество соавторов публикации - 2
Публикации в изданиях, индексируемых в SCOPUS и не индексируемых в Web of Science, K=1
  • Кузнецов А. В.: количество аффилиаций - 2, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 1/(2*2) = 0.25
Статья в периодическом издании

Annotation of a New Low-Threshold Potential-Dependent Calcium Channel of Trichoplax adhaerens (Phylum Placozoa)

SCOPUS 0.251/Q4
DOI https://doi.org/10.1134/S0006350924700040
Язык Английский
Журнал Biophysics

ISSN: 0006-3509; Онлайн ISSN: 1555-6654
Год 2024
Выходные данные Том: 69, Выпуск: 1, Страницы: 25-42
Авторы
  1. Кузнецов А. В. (Kuznetsov A. V.)
    Доп. аффилиация: Institute of Radio-Electronics and Information Security, Sevastopol State University, Sevastopol, 299053 Russia (ru)
  2. Kartashov L. E.
    Department of Instrumental Systems and Automation of Technological Processes, Sevastopol State University, Sevastopol, 299007 Russia (ru)
Даты Поступила в редакцию: 29.06.2020
После доработки 11.11.2022
Принята к публикации: 07.12.2022
Опубликована: 04.07.2024
Абстракт The study of potential-dependent calcium channels sheds light on the formation of systems responsible for the coupling of sensors and actuators in a living cell. Based on data on the potential-sensitive calcium channel TCav3 (2063 amino acid residues) from Trichoplax adhaerens cells, homologues of 2090 amino acid residues in the scaffold of Trichoplax sp. H2 and an incomplete polypeptide with a length of 1510 amino acid residues in the scaffold of Trichoplax adhaerens are identified. The latter hypothetical protein is annotated as a Cav3 channel. An EEDD selective filter is found for all three proteins and the core structure of the calcium channel consisting of 24 transmembrane α-helices is reconstructed. Nevertheless, the studied proteins differ in cytoplasmic domains, which indicates a different specialization of Cav3 channels when conducting a signal into the cell. For example, part of the AID motif (alpha-interacting domain) and the adjacent potential sensor from the annotated channel have homology in 25 species of bony fish, and the corresponding region from other channels in 41 species of bony fish and in 4 species of snakes. Significantly, a highly conserved IIS1-S2 loop with the IEHHNQP sequence is found below the AID motif of bony fish, as in trichoplax; while a homologous IEHHEQP sequence is found in snakes, characterized by a negative glutamic acid residue, which is also present in the corresponding rat and human proteins. Based on the analysis of primary transcripts and mature polypeptides, a modular mechanism for the evolution of Cav3 channels is proposed by inserting and combining protein domains performing various regulatory functions.
Ключевые слова: trichoplax, Cav3-channels, domains, insertions, modular evolution
Сведения о финансировании, указанные в публикации The study was carried out with the financial support from the Government of the Russian Federation under resolution no. 220 (agreement no. 14.W03.31.0015 dated February 28, 2017).
URL https://link.springer.com/article/10.1134/S0006350924700040
Дополнительные сведения

Запись создана: 16-07-2024 11:10
Последнее изменение: 16-07-2024 11:18

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Kuznetsov A. V., Kartashov L. E. Annotation of a New Low-Threshold Potential-Dependent Calcium Channel of Trichoplax adhaerens (Phylum Placozoa) // Biophysics. 2024. Vol. 69, iss. 1. P. 25-42. https://doi.org/10.1134/S0006350924700040
[SCOPUS 0.251/Q4]
Экспертное заключение: № 233, 2023
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Нет
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.251/Q4 (2023)
Идентификатор
2-s2.0-85197499893
РИНЦ
Статус
Нет
ID
EDN

Публикация отнесена к госзаданию:

№ 124022400152-1 «Комплексное исследование механизмов функционирования морских биотехнологических комплексов с целью получения биологически активных веществ из гидробионтов»