База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Число соавторов публикации - 2
Целевой показатель госзадания:
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в WEB of Science (WoS) - Q4 - Формула: 10/корень квадратный из Nавторов = 10/корень квадратный из 2 (1.4142) = 7.07
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в SCOPUS - Q4 - Формула: 6/корень квадратный из Nавторов = 6/корень квадратный из 2 (1.4142) = 4.24
Количество соавторов публикации - 2
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(2*1) = 1.25
  • Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(2*1) = 1.25
Статья в периодическом издании

Structure and Evolution of DNA Transposons of the L31 Superfamily in Bivalves

WoS 1.200/Q4 SCOPUS 0.236/Q4
DOI https://doi.org/10.1134/S0026893324010114
Язык Английский
Журнал Molecular Biology

ISSN: 0026-8933; Онлайн ISSN: 1608-3245
Год 2024
Выходные данные Том: 58, Номер: 1, Страницы: 43-61
Авторы
  1. Пузаков М. В. (Puzakov M. V.)
  2. Пузакова Л. В. (Puzakova L. V.)
Даты Поступила в редакцию: 07.04.2023
После доработки 09.06.2023
Принята к публикации: 09.06.2023
Опубликована: 07.03.2024
Абстракт The mobile genetic elements IS630/Tc1/mariner (ITm) are widespread DNA transposons that make a significant contribution to the evolution of eukaryotic genomes. With the start of large-scale application of next-generation sequencing (NGS) technologies and the emergence of many new whole genome sequences of organisms in nucleotide sequence collections, the ITm elements have been identified in most taxa of the eukaryotic tree of life. Although ITm diversity has been studied in detail, new elements are still found, thus expanding the respective DNA transposon group and calling for review of its classification. Bivalve L31 elements were for the first time analyzed in detail to describe their structures, diversity, distribution, and phylogenetic position among the ITm elements. The L31 transposons were found to form an independent superfamily of an ancient origin within the ITm group. Rather high diversity was observed within the L31 clade; i.e., five phylogenetic clusters were identified. In mollusks, the L31 transposons have been detected only in the subclass Autobranchia and predominate in diversity and number in the infraclass Pteriomorphia. A protein encoded by open reading frame 2 (ORF2) was shown to be an integral structural component of almost all full-length L31 elements. The results provide for a better understanding of the evolution of particular ITm transposons. Further study of the L31 transposons in other taxa (cnidarians) and functional investigation of the ORF2 protein product will help to better understand the evolution of DNA transposons, the mechanisms of their horizontal transfer, and their contribution to eukaryotic biodiversity.
Ключевые слова: DNA transposons, L31 transposons, bivalves, genome evolution, biodiversity
Сведения о финансировании, указанные в публикации This work was supported by a state contract “Functional, Metabolic, and Toxicological Aspects of the Life of Aquatic Organisms and Their Populations in Biotopes with Various Physicochemical Regimens” (no. 121041400077-1) with the Kovalevsky Institute of Biology of the Southern Seas.
URL https://link.springer.com/article/10.1134/S0026893324010114
Дополнительные сведения

Запись создана: 19-03-2024 10:41
Последнее изменение: 19-03-2024 10:49

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V. Structure and Evolution of DNA Transposons of the L31 Superfamily in Bivalves // Molecular Biology. 2024. Vol. 58, no. 1. P. 43-61. https://doi.org/10.1134/S0026893324010114
[WoS 1.200/Q4][SCOPUS 0.236/Q4]
Экспертное заключение: № 197, 2023
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.200/Q4 (2022)
Идентификатор
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.236/Q4 (2022)
Идентификатор
2-s2.0-85187132924
РИНЦ
Статус
Нет
ID
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)

Публикация отнесена к госзаданию:

№ 124030100137-6 «Функциональные, метаболические и молекулярно-генетические механизмы адаптации морских организмов к условиям экстремальных экотопов Черного и Азовского морей и других акваторий Мирового океана»