База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Число соавторов публикации - 3
Целевой показатель госзадания:
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в WEB of Science (WoS) - Q4 - Формула: 10/корень квадратный из Nавторов = 10/корень квадратный из 3 (1.7321) = 5.77
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в SCOPUS - Q4 - Формула: 6/корень квадратный из Nавторов = 6/корень квадратный из 3 (1.7321) = 3.46
Количество соавторов публикации - 3
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
  • Улупова Ю. Н.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833
  • Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833
Статья в периодическом издании

Pogo DNA Transposons in the Genomes of the Aurelia Genus Jellyfish

WoS 0.500/Q4 SCOPUS 0.157/Q4
Перевод
Оригинальная статья:
ДНК-транспозоны pogo в геномах медуз рода Aurelia // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023. Т. 41, № 2. С. 21-27
DOI https://doi.org/10.3103/S089141682302009X
Язык Английский
Журнал Molecular Genetics, Microbiology and Virology

ISSN: 0891-4168; Онлайн ISSN: 1934-841X
Год 2023
Выходные данные Том: 38, Номер: 2, Страницы: 79-85
Авторы
  1. Улупова Ю. Н. (Ulupova Y. N.)
  2. Пузаков М. В. (Puzakov M. V.)
  3. Пузакова Л. В. (Puzakova L. V.)
Даты Поступила в редакцию: 16.09.2022
Принята к публикации: 15.12.2022
Опубликована: 12.09.2023
Абстракт Mobile genetic elements (MGEs) are the DNA sequences capable of moving inside the host genome. As a result of ongoing mutation processes and low natural selection pressure, the evolutionary diversity of MGEs is constantly increasing. Eukaryotic DNA transposons represent a very large and diverse group of MGEs. This work was focused on the study of the pogo DNA transposons in three genomes of jellyfish in the genus Aurelia: Aurelia aurita, Aurelia coerulea, and Aurelia aurita complex sp. In this work, the local alignment method (BLASTn) was used to search for the pogo group MGEs. Multiple amino-acid sequence alignment was performed using MAFFT. It was demonstrated that the majority of pogo elements were represented by the Fot/Fot-like family elements. Two new subfamilies, auFLE1 and auFLE2, were identified in this group. The Jelly group including two elements was also detected in jellyfish. No potentially functional DNA transposons were found among the detected pogo elements. Analysis of the identified pogo elements showed that no active DNA transposons were preserved in the studied jellyfish genomes: all elements are damaged by mutations or have deletions and are not represented by full-size copies. This allowed us to suggest that the activity peak for these transposons took place relatively long ago.
Ключевые слова: Aurelia aurita, Aurelia coerulea, Aurelia aurita complex sp., mobile genetic elements, pogo, DNA transposons, transposase, ITm transposons
Сведения о финансировании, указанные в публикации This work was supported by the state order “Functional, Metabolic, and Toxicological Aspects of Hydrobionts and Their Populations’ Existence in Biotopes with Different Physicochemical Regimens” to the Kovalevsky Institute of Biology of the Southern Seas, state registration no. 121041400077-1.
URL https://link.springer.com/article/10.3103/S089141682302009X
Дополнительные сведения

Запись создана: 18-09-2023 10:41
Последнее изменение: 22-12-2023 15:00

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Ulupova Y. N., Puzakov M. V., Puzakova L. V. Pogo DNA Transposons in the Genomes of the Aurelia Genus Jellyfish // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2023. Vol. 38, no. 2. P. 79-85. https://doi.org/10.3103/S089141682302009X
[Перевод][WoS 0.500/Q4][SCOPUS 0.157/Q4]
Экспертное заключение: № 108, 2023
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.500/Q4 (2022)
Идентификатор
001080293800003
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.157/Q4 (2022)
Идентификатор
2-s2.0-85170684460
РИНЦ
Статус
Нет
ID
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)