Балл 0
Дата внесения публикации в базу 01-08-2023 14:57 не попадает в период стимулирования 01-06-2025 – 31-05-2026
КБПР (методика 2025 г.) = 5
Количество соавторов публикации - 4
Публикация в изданиях из Белого списка уровень: 2, K=10
Публикация в изданиях из Белого списка уровень: 2, K=10
-
Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 10/(4*1) = 2.5 -
Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 10/(4*1) = 2.5
Статья в периодическом издании
maT and mosquito transposons in cnidarians: evolutionary history and intraspecific differences
| DOI | https://doi.org/10.1007/s10142-023-01175-0 |
|---|---|
| Язык | Английский |
| Журнал | Functional and Integrative Genomics ISSN: 1438-793X; Онлайн ISSN: 1438-7948 |
| Год | 2023 |
| Выходные данные | том: 23; выпуск: 3; статья: 244; страниц (электронный ресурс): 15 |
| Авторы | |
| Даты |
Поступила в редакцию: 09.05.2023 После доработки: 07.07.2023 Принята к публикации: 10.07.2023 Опубликована: 16.07.2023 |
| Абстракт | Transposable elements exert a significant effect on the size and structure of eukaryotic genomes. Tc1/mariner superfamily elements represent the widely distributed and highly variable group of DNA transposons. Tc1/mariner elements include TLE/DD34-38E, MLE/DD34D, maT/DD37D, Visitor/DD41D, Guest/DD39D, mosquito/DD37E, and L18/DD37E families, all of which are well or less scarcely studied. However, more detailed research into the patterns of prevalence and diversity of Tc1/mariner transposons enables one to better understand the coevolution of the TEs and the eukaryotic genomes. We performed a detailed analysis of the maT/DD37D family in Cnidaria. The study of 77 genomic assemblies demonstrated that maT transposons are found in a limited number of cnidarian species belonging to classes Cubozoa (1 species), Hydrozoa (3 species) и Scyphozoa (5 species) only. The identified TEs were classified into 5 clades, with the representatives from Pelagiidae (class Scyphozoa) forming a separate clade of maT transposons, which has never been described previously. The potentially functional copies of maT transposons were identified in the hydrae. The phylogenetic analysis and the studies of distribution among the taxons and the evolutionary dynamics of the elements suggest that maT transposons of the cnidarians are the descendants of several independent invasion events occurring at different periods of time. We also established that the TEs of mosquito/DD37E family are found in Hydridae (class Hydrozoa) only. A comparison of maT and mosquito prevalence in two genomic assemblies of Hydra viridissima revealed obvious differences, thus demonstrating that each individual organism might carry a unique mobilome pattern. The results of the presented research make us better understand the diversity and evolution of Tc1/mariner transposons and their effect on the eukaryotic genomes. Ключевые слова: DNA transposons, Tc1/mariner, maT, mosquito, Cnidaria, Genome evolution |
| Сведения о финансировании, указанные в публикации | This research was funded by grants from the Russian Academy of Sciences (121041400077-1) and the National Natural Science Foundation of China (31671313). |
| URL | https://link.springer.com/article/10.1007/s10142-023-01175-0 |
| Дополнительные сведения |
Запись создана: 01-08-2023 14:57
Последнее изменение: 17-06-2024 15:46
Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Shi S., Cheresiz S. V. maT and mosquito transposons in cnidarians: evolutionary history and intraspecific differences // Functional and Integrative Genomics. 2023. Vol. 23, iss. 3. Art. no. 244 (15 p.). https://doi.org/10.1007/s10142-023-01175-0
[WoS 2.900/Q2][SCOPUS 0.675/Q2][БС 2]
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Shi S., Cheresiz S. V. maT and mosquito transposons in cnidarians: evolutionary history and intraspecific differences // Functional and Integrative Genomics. 2023. Vol. 23, iss. 3. Art. no. 244 (15 p.). https://doi.org/10.1007/s10142-023-01175-0
[WoS 2.900/Q2][SCOPUS 0.675/Q2][БС 2]
Экспертное заключение: № 209, 2023
Белый список
Индексация на момент включения в базу:- Уровень БС
- 2
Web of Science
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 2.900/Q2 (2022)
- Идентификатор
- 001029323800001
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 0.675/Q2 (2022)
- Идентификатор
- 2-s2.0-85164875016
В публикации указано госзадание:
№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)