База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Учитывается переводная версия публикации
Количество соавторов публикации - 3
При расчте КБПР учитывается только переводная публикация
  • Улупова Ю. Н.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(3*1) = 0
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(3*1) = 0
  • Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(3*1) = 0
Статья в периодическом издании

ДНК-транспозоны pogo в геномах медуз рода Aurelia

РИНЦ 0.867
Статья с переводом
Переводная статья:
Pogo DNA Transposons in the Genomes of the Aurelia Genus Jellyfish // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2023. Vol. 38, no. 2. P. 79-85
DOI https://doi.org/10.17116/molgen20234102121
Язык Русский
Журнал Молекулярная генетика, микробиология и вирусология

ISSN: 2712-8881; Онлайн ISSN: 0208-0613
Год 2023
Выходные данные Том: 41, Номер: 2, Страницы: 21-27
Авторы
  1. Улупова Ю. Н.
  2. Пузаков М. В.
  3. Пузакова Л. В.
Даты Поступила в редакцию: 16.09.2022
Принята к публикации: 15.12.2022
Абстракт ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ Мобильные генетические элементы (МГЭ) — последовательности ДНК, способные к перемещениям внутри генома хозяина. В результате постоянно идущих мутационных процессов и слабого давления естественного отбора эволюционное разнообразие МГЭ постоянно возрастает. ДНК-транспозоны эукариот представляют собой очень многочисленную и разнообразную группу МГЭ. Данная работа направлена на изучение ДНК-транспозонов pogo в трех геномах медуз рода Aurelia: Aurelia aurita, Aurelia coerulea, Aurelia aurita complex sp. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ В данной работе для поиска МГЭ группы pogo был использован метод локального выравнивания (BLASTn). Множественное выравнивание аминокислотных последовательностей было выполнено с помощью MAFFT.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Показано, что большинство pogo-элементов представлено элементами Fot/Fot-like семейства. В этой группе определено два новых подсемейства — auFLE1 и auFLE2. Также у медуз была выявлена группа Jelly, включающая два элемента. Среди обнаруженных элементов pogo не было найдено потенциально-функциональных ДНК-транспозонов. ЗАКЛЮЧЕНИЕ Анализ выявленных pogo-элементов показал, что активные ДНК-транспозоны в изученных нами геномах медуз не сохранились: все элементы повреждены мутациями или имеют делеции и не представлены полноразмерными копиями. Это позволило предположить, что пик активности данных транспозонов был относительно давно.
Ключевые слова: Aurelia aurita, Aurelia coerulea, Aurelia aurita complex sp, мобильные генетические элементы, pogo, ДНК-транспозоны, транспозаза, ITm-транспозоны

Сведения о финансировании, указанные в публикации Работа выполнялась в рамках государственного задания ФГБУН ИМБИ “Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом”, номер гос. регистрации 121041400077-1.
URL https://www.mediasphera.ru/issues/molekulyarnaya-genetika-mikrobiologiya-i-virusologiya/2023/2/1020806132023021021
Дополнительные сведения

Запись создана: 01-08-2023 14:34
Последнее изменение: 01-08-2023 14:36

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Улупова Ю. Н., Пузаков М. В., Пузакова Л. В. ДНК-транспозоны pogo в геномах медуз рода Aurelia // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023. Т. 41, № 2. С. 21-27. https://doi.org/10.17116/molgen20234102121
[С переводом][РИНЦ 0.867]
Экспертное заключение: № 108, 2023
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Нет
SCOPUS
Статус
Нет
РИНЦ
Статус
Да
Импакт-фактор (год)
0.867 (2021)
ID
54092666
EDN
LQCNYR

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)