База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Число соавторов публикации - 7
Целевой показатель госзадания:
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в WEB of Science (WoS) - Q2 - Формула: 20/корень квадратный из Nавторов = 20/корень квадратный из 7 (2.6458) = 7.56
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в SCOPUS - Q2 - Формула: 10/корень квадратный из Nавторов = 10/корень квадратный из 7 (2.6458) = 3.78
Количество соавторов публикации - 7
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q2, K=10
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 10/(7*1) = 1.429
Статья в периодическом издании

Mosquito (MS), a DD37E Family of Tc1/Mariner, Displaying a Distinct Evolution Profile from DD37E/TRT and DD37E/L18

WoS 3.500/Q2 SCOPUS 0.924/Q2
DOI https://doi.org/10.3390/genes14071379
Язык Английский
Журнал Genes

ISSN: 2073-4425; Онлайн ISSN: –
Год 2023
Выходные данные Том: 14, Выпуск: 7, Статья: 1379, Страниц (электронный ресурс): 10
Авторы
  1. Xiang K.
    College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China (cc)
  2. Пузаков М. В. (Puzakov M.)
  3. Shi S.
    College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China (cc)
  4. Diaby M.
    College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China (cc)
  5. Ullah N.
    College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China (cc)
  6. Gao B.
    College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China (cc)
  7. Song C.
    College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China (cc)
Даты Поступила в редакцию: 02.06.2023
После доработки 26.06.2023
Принята к публикации: 26.06.2023
Опубликована: 29.06.2023
Абстракт Diverse Tc1/mariner elements with the DD37E signature have been detected. However, their evolutionary relationship and profiles are largely unknown. Using bioinformatics methods, we defined the evolution profile of a Tc1/Mariner family, which harbors the catalytic domain with the DD37E signature, and renamed it DD37E/Mosquito (MS). MS transposons form a separate monophyletic clade in the phylogenetic tree, distinct from the other two groups of elements with the DD37E signature, DD37E/L18 and DD37E/TRT (transposon related to Tc1), and represent a very different taxonomic distribution from that of DD37E/TRT. MS is only detected in invertebrate and is mostly present in Arthropoda, as well as in Cnidaria, Ctenophora, Mollusca, Nematoda, and Platyhelminthes, with a total length of about 1.3 kb, containing an open reading frame (ORF) encoding about 340 amino acids transposases, with a conserved DD37E catalytic domain. The terminal inverted repeat (TIR) lengths range from 19 bp to 203 bp, and the target site duplication (TSD) is TA. We also identified few occurrences of MS horizontal transfers (HT) across lineages of diptera. In this paper, the distribution characteristics, structural characteristics, phylogenetic evolution, and horizontal transfer of the MS family are fully analyzed, which is conducive to supplementing and improving the Tc1/Mariner superfamily and excavating active transposons.
Ключевые слова: transposon, Tc1/Mariner, DD37E/Mosquito, horizontal transfer
Сведения о финансировании, указанные в публикации This research was funded by grants from the National Natural Science Foundation of China (32271508 and 31671313), the High-end Talent Support Program of Yangzhou University to Chengyi Song, and the Russian Academy of Sciences (121041400077-1) to Mikhail Puzakov.
URL https://www.mdpi.com/2073-4425/14/7/1379
Дополнительные сведения

Запись создана: 10-07-2023 09:17
Последнее изменение: 21-12-2023 14:36

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Xiang K., Puzakov M., Shi S., Diaby M., Ullah N., Gao B., Song C. Mosquito (MS), a DD37E Family of Tc1/Mariner, Displaying a Distinct Evolution Profile from DD37E/TRT and DD37E/L18 // Genes. 2023. Vol. 14, iss. 7. Art. no. 1379 (10 p.). https://doi.org/10.3390/genes14071379
[WoS 3.500/Q2][SCOPUS 0.924/Q2]
Экспертное заключение: № 198, 2023
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
3.500/Q2 (2022)
Идентификатор
001036090600001
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.924/Q2 (2022)
Идентификатор
2-s2.0-85165957024
РИНЦ
Статус
Нет
ID
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)