База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Дата внесения публикации в базу 12-08-2018 12:24 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
Количество соавторов публикации - 5
При расчте КБПР учитывается только переводная публикация
  • Малахова Т. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(5*1) = 0
Статья в периодическом издании

Филогенетическое разнообразие бактерий цикла серы в донных осадках Херсонесской бухты

РИНЦ 1.489
Статья с переводом
Переводная статья:
Phylogenetic Diversity of the Sulfur Cycle Bacteria in the Bottom Sediments of the Chersonesus Bay // Microbiology. 2018. Vol. 87, no. 3. P. 372–381
DOI https://doi.org/10.7868/S0026365618030060
Язык Русский
Журнал Микробиология

ISSN: 0026-3656; Онлайн ISSN: –
Год 2018
Выходные данные Том: 87, Номер: 3, Страницы: 279–290
Авторы
  1. Брюханов А. Л.
    Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Москва, Россия (ru)
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
  2. Власова М. А.
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
  3. Малахова Т. В.
  4. Перевалова А. А.
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
  5. Пименов Н. В.
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
Даты Поступила в редакцию: 19.09.2017
Абстракт Черное море - крупнейший меромиктический водоем, в донных осадках которого протекает мощный биогенный процесс образования сероводорода. Целью настоящей работы стало получение данных о филогенетическом разнообразии микроорганизмов цикла серы (сульфатредуцирующих и сероокисляющих бактерий), обитающих в черноморских прибрежных газонасыщенных донных отложениях. Образцы отбирали в Херсонесской (Голубой) бухте в акватории г. Севастополя из белёсых бактериальных обрастаний сульфуретт, а также из верхнего слоя близлежащего грунта. С препаратами ДНК, выделенными из нативных проб и полученных накопительных культур, был проведен ПЦР-анализ с использованием олигонуклеотидных праймеров, специфичных к участкам гена 16S рРНК основных подгрупп сульфатредуцирующих бактерий (СРБ), а также к участкам гена dsrB (восстановительного и окислительного типов), который кодирует β-субъединицу диссимиляционной (би)сульфитредуктазы - ключевого фермента цикла серы, присущего сульфатредуцирующим и сероокисляющим мик­роорганизмам. В пробах ДНК, выделенных из прибрежных донных микробных обрастаний, показано наличие участков гена 16S рРНК, которые характерны для представителей родов Desulfobacterium, Desulfobacter, Desulfococcus-Desulfonema-Desulfosarcina и Desulfovibrio-Desulfomicrobium. Методом денатурирующего градиентного гель-электрофореза (ДГГЭ) с последующим секвенированием реамплифицированных участков гена dsrB было показано, что по аминокислотным последовательностям, кодируемым геном dsrB восстановительного типа, СРБ из прибрежных газонасыщенных донных осадков Черного моря имели наибольшую гомологию (92-99%) с геном dsrB культивируемых СРБ родов Desulfovibrio, Desulfatitalea, Desulfobacter, Desulfobacterium. Выявлена также высокая гомология с некультивируемыми штаммами СРБ из различных морских местообитаний, в частности, из донных осадков Северного и Японского морей. Аминокислотные последовательности, кодируемые геном dsrB окислительного типа, обладали наибольшей гомологией (90-99%) к соответствующему гену представителей сероокисляющих бактерий родов Thiocapsa, Thiobaca, Thioflavicoccus и Thiorhodococcus.
Ключевые слова: cульфатредуцирующие бактерии, сероокисляющие (тионовые) бактерии, Черное море, донные осадки, микробные маты, сообщества микроорганизмов, диссимиляционная (би)сульфитредуктаза, ген dsrB
Сведения о финансировании, указанные в публикации
URL https://elibrary.ru/item.asp?id=35101337
Дополнительные сведения

Запись создана: 12-08-2018 12:24
Последнее изменение: 05-11-2020 13:03

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Брюханов А. Л., Власова М. А., Малахова Т. В., Перевалова А. А., Пименов Н. В. Филогенетическое разнообразие бактерий цикла серы в донных осадках Херсонесской бухты // Микробиология. 2018. Т. 87, № 3. С. 279–290. https://doi.org/10.7868/S0026365618030060
[С переводом][РИНЦ 1.489]
Экспертное заключение: –
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Нет
SCOPUS
Статус
Нет
РИНЦ
Статус
Да
Импакт-фактор (год)
1.489 (2017)
ID
35101337
EDN

Публикация отнесена к госзаданию:

№ 121031500515-8 «Молисмологические и биогеохимические основы гомеостаза морских экосистем» (предыдущий номер АААА-А18-118020890090-2)