Балл 0
Дата внесения публикации в базу 03-04-2023 12:51 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
КБПР (данная функция работает в тестовом режиме) 2.499
Количество соавторов публикации - 3
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
-
Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833 -
Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833 -
Улупова Ю. Н.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833
Статья в периодическом издании
Differential Activity of Genes with IS630/TC1/MARINER Transposon Fragments in the Genome of the Ctenophore Mnemiopsis leidyi
| Перевод Оригинальная статья: Дифференциальная активность генов с фрагментами транспозонов IS630/Tc1/mariner в геноме гребневика Mnemiopsis leidyi // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2022. Т. 40, № 4. С. 30-35 |
|
| DOI | https://doi.org/10.3103/S089141682204005X |
|---|---|
| Язык | Английский |
| Журнал | Molecular Genetics, Microbiology and Virology ISSN: 0891-4168; Онлайн ISSN: 1934-841X |
| Год | 2022 |
| Выходные данные | Том: 37, Номер: 4, Страницы: 194-201 |
| Авторы | |
| Даты |
Поступила в редакцию: 03.12.2021 Принята к публикации: 15.04.2022 После доработки 30.03.2022 Опубликована: 20.03.2023 |
| Абстракт | Mobile genetic elements (MGEs) have a significant impact on genome structure and function being also a source of new genes. As a result of “molecular domestication,” genes encoded by MGEs become functional parts of the host genome. The IS630/Tc1/mariner (ITm) DNA transposon superfamily is one of the most widespread and diverse. To date, several genes are known to have resulted from the ITm transposon co-option. The aim of the present work was to search for the ctenophore Mnemiopsis leidyi genes with integrated fragments of ITm-transposons and subsequent analysis of their of expression levels. In the present work, the local alignment method (BLASTn) was used to search for the hypothetical chimeric genes. The analysis of differential gene activity was performed with the combined use of the Kallisto and Sleuth software. No cDNAs were found that would match the full coding sequence of any M. leidyi ITm transposase. However, 21 unique transcripts of hypothetical chimeric genes containing regions homologous to ITm transposons have been found. Transcriptional analysis showed that during early embryonic development, as well as in the crest and epithelium tissues of adult animals, most hypothetical chimeric genes are not expressed or are expressed at a low level. However, several loci showed differential activity levels during regeneration. The differential activity of some hypothetical chimeric genes during regeneration may indicate their possible “domestication” and involvement in molecular genetic processes in ctenophores. Ключевые слова: molecular domestication, DNA transposons, chimeric genes, transcriptional activity |
| Сведения о финансировании, указанные в публикации | This work was supported by the “Functional, Metabolic, and Toxicological Aspects of Hydrobionts and Their Populations in Biotopes with Different Physical and Chemical Conditions” state order to the Kovalevsky Institute of the Biology of Southern Seas (state registration no. 121041400077-1) and the Russian Foundation for Basic Research and the city of Sevastopol (project no. 18-44-920002). |
| URL | https://link.springer.com/article/10.3103/S089141682204005X |
| Дополнительные сведения | |
Запись создана: 03-04-2023 12:51
Последнее изменение: 22-12-2023 09:51
Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Ulupova Y. N. Differential Activity of Genes with IS630/TC1/MARINER Transposon Fragments in the Genome of the Ctenophore Mnemiopsis leidyi // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2022. Vol. 37, no. 4. P. 194-201. https://doi.org/10.3103/S089141682204005X
[Перевод][WoS 0.493/Q4][SCOPUS 0.154/Q4]
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Ulupova Y. N. Differential Activity of Genes with IS630/TC1/MARINER Transposon Fragments in the Genome of the Ctenophore Mnemiopsis leidyi // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2022. Vol. 37, no. 4. P. 194-201. https://doi.org/10.3103/S089141682204005X
[Перевод][WoS 0.493/Q4][SCOPUS 0.154/Q4]
Экспертное заключение: № 85, 2022
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Web of Science
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 0.493/Q4 (2021)
- Идентификатор
- 000956642100005
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 0.154/Q4 (2021)
- Идентификатор
- 2-s2.0-85150457349
- Статус
- Нет
- ID
- –
- EDN
- –
В публикации указано госзадание:
№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)