При расчте КБПР учитывается только переводная публикация
-
Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(3*1) = 0 -
Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(3*1) = 0 -
Улупова Ю. Н.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(3*1) = 0
Статья в периодическом издании
Дифференциальная активность генов с фрагментами транспозонов IS630/Tc1/mariner в геноме гребневика Mnemiopsis leidyi
Статья с переводом Переводная статья: Differential Activity of Genes with IS630/TC1/MARINER Transposon Fragments in the Genome of the Ctenophore Mnemiopsis leidyi // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2022. Vol. 37, no. 4. P. 194-201 |
|
DOI | https://doi.org/10.17116/molgen20224004130 |
---|---|
Язык | Русский |
Журнал | Молекулярная генетика, микробиология и вирусология ISSN: 2712-8881; Онлайн ISSN: 0208-0613 |
Год | 2022 |
Выходные данные | Том: 40, Номер: 4, Страницы: 30-35 |
Авторы | |
Даты |
Поступила в редакцию: 03.12.2021 Принята к публикации: 15.04.2022 |
Абстракт | ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯМобильные генетические элементы (МГЭ) оказывают значительное влияние на структуру и функционирование генома и являются источником новых генов. В результате «молекулярного одомашнивания» гены МГЭ становятся функциональной частью генома хозяина. Суперсемейство ДНК-транспозонов IS630/Tc1/mariner (ITm) является одним из самых широко распространенных и разнообразных. К настоящему времени известно несколько генов, которые появились вследствие кооптации ITm-транспозонов. Данная работа была направлена на поиск генов гребневика Mnemiopsis leidyi, в последовательность которых были включены фрагменты ITm-транспозонов, с последующим анализом их уровня экспрессии. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫВ представленной работе для поиска гипотетических химерных генов был использован метод локального выравнивания (BLASTn). Анализ дифференциальной активности генов оценивали с помощью совместного использования программ Kallisto и Sleuth. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕНе было обнаружено ни одной кДНК, которая бы соответствовала полной кодирующей последовательности транспозазы какого-либо ITm-транспозона M. leidyi. Однако был обнаружен 21 уникальный транскрипт гипотетических химерных генов, имеющих участки гомологичные ITm-транспозонам. Транскрипционный анализ показал, что в процессе раннего эмбрионального развития, а также в тканях гребней и эпителия взрослых животных преобладающая доля гипотетических химерных генов не экспрессируется либо экспрессируется на низком уровне. Однако в нескольких локусах фиксируется дифференциальный уровень активности в процессе регенерации. ЗАКЛЮЧЕНИЕДифференциальная активность отдельных гипотетических химерных генов в процессе регенерации может свидетельствовать об их возможном «одомашнивании» и вовлеченности в молекулярно-генетические процессы гребневиков. Ключевые слова: молекулярная доместикация, ДНК-транспозоны, химерные гены, транскрипционная активность |
Сведения о финансировании, указанные в публикации | Работа проведена в рамках государственного задания ФГБУН «ИМБИ» «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом», номер гос. регистрации 121041400077-1 и при финансовой поддержке РФФИ и города Севастополя в рамках научного проекта №18-44-920002. |
URL | https://www.mediasphera.ru/issues/molekulyarnaya-genetika-mikrobiologiya-i-virusologiya/2022/4/1020806132022041030 |
Дополнительные сведения |
Запись создана: 23-01-2023 12:51
Последнее изменение: 23-01-2023 12:55
Пузаков М. В., Пузакова Л. В., Улупова Ю. Н. Дифференциальная активность генов с фрагментами транспозонов IS630/Tc1/mariner в геноме гребневика Mnemiopsis leidyi // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2022. Т. 40, № 4. С. 30-35. https://doi.org/10.17116/molgen20224004130
[С переводом][РИНЦ 0.852]
Web of Science
- Статус
- Нет
- Статус
- Нет
Публикация отнесена к госзаданию: