Балл 0
Дата внесения публикации в базу 12-08-2018 11:18 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
КБПР (данная функция работает в тестовом режиме) 0.5
Количество соавторов публикации - 5
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
-
Малахова Т. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(5*1) = 0.5
Статья в периодическом издании
Phylogenetic Diversity of the Sulfur Cycle Bacteria in the Bottom Sediments of the Chersonesus Bay
| Перевод Оригинальная статья: Филогенетическое разнообразие бактерий цикла серы в донных осадках Херсонесской бухты // Микробиология. 2018. Т. 87, № 3. С. 279–290 |
|
| DOI | https://doi.org/10.1134/S0026261718030025 |
|---|---|
| Язык | Английский |
| Журнал | Microbiology ISSN: 0026-2617; Онлайн ISSN: 1608-3237 |
| Год | 2018 |
| Выходные данные | Том: 87, Номер: 3, Страницы: 372–381 |
| Авторы | |
| Даты |
Поступила в редакцию: 19.09.2017 Опубликована онлайн: 02.06.2018 |
| Абстракт | The Black Sea is the largest meromictic basin, in the bottom sediments of which a powerful biogenic process of sulfide production occurs. The goal of the present work was to obtain data on phylogenetic diversity of the sulfur cycle microorganisms (sulfate-reducing and sulfur-oxidizing bacteria) in the Black Sea coastal gas-saturated bottom sediments. The samples were collected in the Chersonesus (Blue) Bay near Sevastopol from whitish bacterial mats of sulfurettes, and from the upper layer of the nearby seabed. Using DNA isolated from the native samples and obtained enrichment cultures, PCR analysis was performed with oligonucleotide primers specific to the fragments of the 16S rRNA genes of the main subgroups of sulfatereducing bacteria (SRB) and to the fragments of the dsrB gene (both reductive and oxidative types), encoding the β-subunit of dissimilatory (bi)sulfite reductase, the key enzyme in the sulfur cycle, inherent in both sulfate- reducing and sulfur-oxidizing microorganisms. The presence of 16S rRNA gene fragments specific to the genera Desulfobacterium, Desulfobacter, Desulfococcus–Desulfonema–Desulfosarcina, and Desulfovibrio–Desulfomicrobium was detected in the DNA samples isolated from coastal bottom bacterial mats. Usage of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) with subsequent sequencing of reamplified dsrB gene fragments revealed that according to deduced amino acid sequences encoded by the dsrB gene (reductive type), SRB from the coastal gas-saturated bottom sediments of the Black Sea had the highest homology (92−99%) with the dsrB gene of cultured SRB belonging to the genera Desulfovibrio, Desulfatitalea, Desulfobacter, and Desulfobacterium, as well as with uncultured SRB strains from various marine habitats, such as bottom sediments of the Northern and Japanese seas. Deduced amino acid sequences encoded by the oxidative dsrB gene had the highest homology (90−99%) with the relevant sequences of the genera Thiocapsa, Thiobaca, Thioflavicoccus, and Thiorhodococcus. Ключевые слова: sulfate-reducing bacteria, sulfur-oxidizing (thionic) bacteria, the Black Sea, bottom sediments, microbial mats, microbial communities, dissimilatory (bi)sulfite reductase, dsrB gene |
| Сведения о финансировании, указанные в публикации | |
| URL | https://link.springer.com/article/10.1134%2FS0026261718030025 |
| Дополнительные сведения | |
Запись создана: 12-08-2018 11:18
Последнее изменение: 08-06-2020 10:46
Библиографическая ссылка:
Bryukhanov A. L., Vlasova M. A., Malahova T. V., Perevalova A. A., Pimenov N. V. Phylogenetic Diversity of the Sulfur Cycle Bacteria in the Bottom Sediments of the Chersonesus Bay // Microbiology. 2018. Vol. 87, no. 3. P. 372–381. https://doi.org/10.1134/S0026261718030025
[Перевод][WoS 0.855/Q4][SCOPUS 0.302/Q3]
Bryukhanov A. L., Vlasova M. A., Malahova T. V., Perevalova A. A., Pimenov N. V. Phylogenetic Diversity of the Sulfur Cycle Bacteria in the Bottom Sediments of the Chersonesus Bay // Microbiology. 2018. Vol. 87, no. 3. P. 372–381. https://doi.org/10.1134/S0026261718030025
[Перевод][WoS 0.855/Q4][SCOPUS 0.302/Q3]
Экспертное заключение: –
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Web of Science
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 0.855/Q4 (2017)
- Идентификатор
- 000434054800008
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 0.302/Q3 (2017)
- Идентификатор
- 2-s2.0-85053402557
- Статус
- Нет
- ID
- 35723186
- EDN
- –
Публикация отнесена к госзаданию:
№ 121031500515-8 «Молисмологические и биогеохимические основы гомеостаза морских экосистем» (предыдущий номер АААА-А18-118020890090-2)