База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Дата внесения публикации в базу 10-06-2022 10:04 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
Количество соавторов публикации - 2
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(2*1) = 1.25
  • Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(2*1) = 1.25
Статья в периодическом издании

Prevalence, Diversity, and Evolution of L18 (DD37E) Transposons in the Genomes of Cnidarians

WoS 1.374/Q4 SCOPUS 0.192/Q4
Перевод
Оригинальная статья:
Распространенность, разнообразие и эволюция ДНК-транспозонов L18 (DD37E) в геномах стрекающих (Cnidaria) // Молекулярная биология. 2022. T. 56, № 3. C. 476-490
DOI https://doi.org/10.1134/S0026893322030104
Язык Английский
Журнал Molecular Biology

ISSN: 0026-8933; Онлайн ISSN: 1608-3245
Год 2022
Выходные данные Том: 56, Номер: 3, Страницы: 424-436
Авторы
  1. Пузаков М. В. (Puzakov M. V.)
  2. Пузакова Л. В. (Puzakova L. V.)
Даты Поступила в редакцию: 02.10.2021
После доработки 02.11.2021
Принята к публикации: 03.11.2021
Опубликована онлайн: 03.06.2022
Абстракт Transposable elements have a significant impact on the structure and functioning of multicellular genomes, and also serve as a source of new genes. Studying the diversity and evolution of transposable elements in different taxa is necessary for the fundamental understanding of their role in genomes. The Tc1/mariner elements are one of the most widespread and diverse groups of DNA transposons. In this work, the structure, distribution, diversity, and evolution of the L18 (DD37E) elements in the genomes of cnidarians (Cnidaria) were studied for the first time. As a result, it was found that the L18 group is an independent family (and not a subfamily of the TLE family, as previously thought) in the Tc1/mariner superfamily. Of the 51 detected elements, only four had potentially functional copies. It is assumed that the L18 transposons are of ancient origin, and, in addition, the elements found in the genomes of organisms of the Anthozoa and Hydrozoa classes do not come from a common ancestral transposon within the Cnidaria phylum. In organisms of the Hydrozoa class, L18 transposons appeared as a result of horizontal transfer at a later time period. An intraspecies comparison of the diversity of the L18 elements demonstrates high homogeneity with respect to “old” transposons, which have already lost their activity. At the same time, distant populations, as in the case of Hydra viridissima, have differences in the representation of DNA transposons and the number of copies. These data supplement the knowledge on the diversity and evolution of Tc1/mariner transposons and contribute to the study of the influence of mobile genetic elements on the evolution of multicellular organisms.
Ключевые слова: DNA transposons, Tc1/mariner, L18, cnidarians, Cnidaria, genome evolution
Сведения о финансировании, указанные в публикации This study was carried out within the state task of the Federal Research Center of the InBYuM “Functional, meta- bolic and toxicological aspects of the existence of hydrobionts and their populations in biotopes with different physicochem- ical regimes”, state registration no. 121041400077-1.
URL https://link.springer.com/article/10.1134/S0026893322030104
Дополнительные сведения

Запись создана: 10-06-2022 10:04
Последнее изменение: 22-12-2023 09:50

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V. Prevalence, Diversity, and Evolution of L18 (DD37E) Transposons in the Genomes of Cnidarians // Molecular Biology. 2022. Vol. 56, no. 3. P. 424-436. https://doi.org/10.1134/S0026893322030104
[Перевод][WoS 1.374/Q4][SCOPUS 0.192/Q4]
Экспертное заключение: № 468, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.374/Q4 (2020)
Идентификатор
000805814600009
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.192/Q4 (2021)
Идентификатор
2-s2.0-85131659275
РИНЦ
Статус
Нет
ID
48719935
EDN
OUHAWD

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)