Балл 0
Дата внесения публикации в базу 15-11-2021 17:06 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
КБПР (данная функция работает в тестовом режиме) 1.667
Количество соавторов публикации - 3
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q3, K=5
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q3, K=5
-
Водясова Е. А.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(3*1) = 1.667
Статья в периодическом издании
Identification and characterization of the novel genes encoding glutathione S-transferases in Mytilus galloprovincialis
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.cbd.2021.100926 |
|---|---|
| Язык | Английский |
| Журнал | Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics ISSN: 1744-117X; Онлайн ISSN: 1878-0407 |
| Год | 2021 |
| Выходные данные | Том: 50, Статья: 100926, Страниц (электронный ресурс): 9 |
| Авторы | |
| Даты |
Поступила в редакцию: 22.06.2021 После доработки 06.10.2021 Принята к публикации: 18.10.2021 Опубликована онлайн: 26.10.2021 |
| Абстракт | The superfamily of glutathione S-transferases (GST) plays an essential role in the xenobiotic metabolism, binding compounds to the glutathione, and is like a cell protector during the influence of various negative external factors. Nevertheless, there are very few works devoted to the investigation of these genes in marine invertebrates. Up to this time, only three classes of cytosolic GSTs for one of the leading commercial molluscs Mytilus galloprovincialis were described. We sequenced the whole transcriptome from the gill tissues and, using bioinformatic analysis, detected ten classes of glutathione S-transferases, which are expressed in the mussel M. galloprovincialis. For the first time, two subfamilies were described: mitochondrial GST (kappa class) and microsomal (MAPEG), as well as five classes of the family of cytosolic GSTs (mu, omega, rho, tau, theta). Omega and sigma GST classes might be rapidly regulated genes due to the lack of introns and this assumption was confirmed by the investigation of short-term hypoxia on M. galloprovincialis. Seven new classes of GST revealed a greater gene variety of this detoxifying enzyme in mussels than expected. The obtained nucleotide sequences are necessary for future investigations of GSTs expression in response to various external factors (pollution, oxygen starvation, infection, etc.). Ключевые слова: transcriptome , RNA-seq, Mytilus galloprovincialis, glutathione S-transferases, gene expression, exon-intron structure |
| Сведения о финансировании, указанные в публикации | . This work is funded by State Assignment No. AAAA-A18-118020890074-2 (identifi- cation and phylogeny of GSTs), the Ministry of Education and Science of the Russian Federation grant No. 14.W03.31.0015 (RNA extraction, cDNA preparation and sequencing) and an internal grant of SSU for 2020 No. 33/06-31 (transcriptome assembly). The RNA-seq data anal- ysis performed using computational resources of the “Bioinformatics” Joint Computational Center of the Institute of Cytology and Genetics SB RAS |
| URL | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1744117X21001386 |
| Дополнительные сведения |
Запись создана: 15-11-2021 17:06
Последнее изменение: 02-12-2021 16:43
Библиографическая ссылка:
Vodiasova E. A., Meger Y. V., Lantushenko A. O. Identification and characterization of the novel genes encoding glutathione S-transferases in Mytilus galloprovincialis // Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics. 2021. Vol. 40. Article no. 100926 (9 p.). https://doi.org/10.1016/j.cbd.2021.100926
[WoS 2.674/Q3][SCOPUS 0.648/Q1]
Vodiasova E. A., Meger Y. V., Lantushenko A. O. Identification and characterization of the novel genes encoding glutathione S-transferases in Mytilus galloprovincialis // Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics. 2021. Vol. 40. Article no. 100926 (9 p.). https://doi.org/10.1016/j.cbd.2021.100926
[WoS 2.674/Q3][SCOPUS 0.648/Q1]
Экспертное заключение: № 454, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Web of Science
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 2.674/Q3 (2020)
- Идентификатор
- 000721365600001
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 0.648/Q1 (2020)
- Идентификатор
- 2-s2.0-85118505281
- Статус
- Нет
- ID
- –
- EDN
- –
В публикации указано госзадание:
№ 121030100028-0 «Закономерности формирования и антропогенная трансформация биоразнообразия и биоресурсов Азово-Черноморского бассейна и других районов Мирового океана» (предыдущий номер АААА-А18-118020890074-2)