База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Дата внесения публикации в базу 20-10-2021 11:15 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
Количество соавторов публикации - 9
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q1, K=20
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 20/(9*1) = 2.222
Статья в периодическом издании

Prokaryotic and Eukaryotic Horizontal Transfer of Sailor (DD82E), a New Superfamily of IS630-Tc1-Mariner DNA Transposons

WoS 5.079/Q1 SCOPUS 1.731/Q1
DOI https://doi.org/10.3390/biology10101005
Язык Английский
Журнал Biology

ISSN: —; Онлайн ISSN: 2079-7737
Год 2021
Выходные данные Статья: 1005, Страниц (электронный ресурс): 15
Авторы
  1. Shi S.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
  2. Пузаков М. В. (Puzakov M.)
  3. Guan Z.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
  4. Xiang K.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
  5. Diaby M.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
  6. Wang Y.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
  7. Wang S.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
  8. Song C.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
  9. Gao B.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
Даты Поступила в редакцию: 30.08.2021
После доработки 26.09.2021
Принята к публикации: 28.09.2021
Опубликована: 07.10.2021
Абстракт Here, a new superfamily of IS630-Tc1-mariner (ITm) DNA transposons, termed Sailor, is identified, that is characterized by a DD82E catalytic domain and is distinct from all previously known superfamilies of the ITm group. Phylogenetic analyses revealed that Sailor forms a monophyletic clade with a more intimate link to the clades of Tc1/mariner and DD34E/Gambol. Sailor was detected in both prokaryotes and eukaryotes and invaded a total of 256 species across six kingdoms. Sailor is present in nine species of bacteria, two species of plantae, four species of protozoa, 23 species of Chromista, 12 species of Fungi and 206 species of animals. Moreover, Sailor is extensively distributed in invertebrates (a total of 206 species from six phyla) but is absent in vertebrates. Sailor transposons are 1.38–6.98 kb in total length and encoded transposases of ~676 aa flanked by TIRs with lengths between 18, 1362 and 4 bp (TATA) target-site duplications. Furthermore, our analysis provided strong evidence of Sailor transmissions from prokaryotes to eukaryotes and internal transmissions in both. These data update the classification of the ITm group and will contribute to the understanding of the evolution of ITm transposons and that of their hosts.
Ключевые слова: Tc1/mariner transposons, DD82E/Sailor, horizontal transfer
Сведения о финансировании, указанные в публикации This research was funded by grants from the National Genetically Modified Organisms Breeding Major Projects program (2018ZX08010-08B), Russian Academy of Sciences (121041400077-1), the National Natural Science Foundation of China (31671313), the Priority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education Institutions, and the High-end Talent Support Program of Yangzhou University to Chengyi Song
URL https://www.mdpi.com/2079-7737/10/10/1005/htm
Дополнительные сведения

Запись создана: 20-10-2021 11:15
Последнее изменение: 18-11-2021 11:25

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Shi S., Puzakov M., Guan Z., Xiang K., Diaby M., Wang Y., Wang S., Song C., Gao B. Prokaryotic and Eukaryotic Horizontal Transfer of Sailor (DD82E), a New Superfamily of IS630-Tc1-Mariner DNA Transposons // Biology. 2021. Vol. 10, iss. 10. Article no. 1005 (15 p.). https://doi.org/10.3390/biology10101005
[WoS 5.079/Q1][SCOPUS 1.731/Q1]
Экспертное заключение: № 397, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
5.079/Q1 (2020)
Идентификатор
000713173100001
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.731/Q1 (2020)
Идентификатор
2-s2.0-85117217156
РИНЦ
Статус
Нет
ID
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)