База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Дата внесения публикации в базу 04-10-2021 14:50 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
Количество соавторов публикации - 5
Публикация не попадает под расчет КБПР
  • Кузнецов А. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(5*1) = 0
Статья в периодическом издании

Присваивание функций опсинам трихоплаксов Trichoplax adhaerens и Trichoplax sp. H2

РИНЦ 0.053
DOI
Язык Русский
Журнал Актуальные вопросы биологической физики и химии

ISSN: 2499-9962; Онлайн ISSN: –
Год 2021
Выходные данные Том: 6, Номер: 4, Страницы: 686-694
Авторы
  1. Хавронюк И. С.
    Севастопольский государственный университет (ru)
  2. Мамонтов А. А.
    Севастопольский государственный университет (ru)
  3. Булков В. А.
    Севастопольский государственный университет (ru)
  4. Воронин Д. П.
    Севастопольский государственный университет (ru)
  5. Кузнецов А. В.
Даты Поступила в редакцию: 07.08.2021
Абстракт В геноме трихоплакса Trichoplax sp. H2 присутствует 10 генов, кодирующих светочувствительные белки-опсины, из них 7 аннотированы как цветочувствительные опсины, от зелёного до ультрафиолетового. В свою очередь, в геноме трихоплакса Trichoplax adhaerens также обнаружены 10 опсино-подобных генов. Для половины из этих полипептидов восстановлены полные аминокислотные последовательности. В силу того, что опсины Trichoplax adhaerens (гаплотип H1) охарактеризованы неполно, представляло интерес провести дополнительное исследование опсинов трихоплакса гаплотипа H1. Для этого были осуществлены множественные выравнивания 20 аминокислотных последовательностей опсинов обоих штаммов трихоплакса и построены деревья родства опсинов. С помощью гомологического сравнения были созданы структурные модели исследуемых протеинов и осуществлён докинг хромофора ретиналя. На основании проведённых расчётов 3 полным гипотетическим белкам: EDV19328.1 длиной 465 aa, EDV22726.1 длиной 365 aa и EDV22897.1 длиной 319 aa из Trichoplax adhaerens была присвоена функция чувствительности к голубому свету. С меньшим правдоподобием чувствительность к голубому свету может быть присвоена 4 неполным гомологичным белкам: EDV22727.1 длиной 287 aa, EDV19349.1 – 188 aa, EDV19891.1 – 161 aa и EDV18601.1 длиной 137 aa из штамма H1. Присутствие множественных генов опсинов в геномах трихоплаксов гаплотипов H1 и H2 позволяет предположить, что Placozoa способны различать оттенки голубого цвета, а это, возможно, позволяет им ориентироваться в тоще морской воды.
Ключевые слова: аннотация, биологические функции, гомология, опсины, структурное моделирование, Placozoa
Сведения о финансировании, указанные в публикации
URL
Дополнительные сведения

Запись создана: 04-10-2021 14:50
Последнее изменение: 05-04-2024 12:43

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Хавронюк И. С., Мамонтов А. А., Булков В. А., Воронин Д. П., Кузнецов А. В. Присваивание функций опсинам трихоплаксов Trichoplax adhaerens и Trichoplax sp. H2 // Актуальные вопросы биологической физики и химии. 2021. Т. 6, № 4. С. 686-694.
[РИНЦ 0.053]
Экспертное заключение: № 450, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Нет
SCOPUS
Статус
Нет
РИНЦ
Статус
Да
Импакт-фактор (год)
0.053 (2020)
ID
49507993
EDN
XOMTIS

Публикация отнесена к госзаданию:

№ 121030100028-0 «Закономерности формирования и антропогенная трансформация биоразнообразия и биоресурсов Азово-Черноморского бассейна и других районов Мирового океана» (предыдущий номер АААА-А18-118020890074-2)