База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Дата внесения публикации в базу 14-05-2021 10:16 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
Количество соавторов публикации - 3
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q3, K=5
  • Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(3*1) = 1.667
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(3*1) = 1.667
  • Гостюхина О. Л.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 5/(3*1) = 1.667
Статья в периодическом издании

Newly Discovered AqE Gene is Highly Conserved in Non-tetrapod Vertebrates

WoS 1.821/Q3 SCOPUS 0.591/Q2
DOI https://doi.org/10.1007/s00239-021-09997-x
Язык Английский
Журнал Journal of Molecular Evolution

ISSN: 0022-2844; Онлайн ISSN: 1432-1432
Год 2021
Выходные данные Том: 89, Выпуск: 4-5, Страницы: 214-224
Авторы
  1. Пузакова Л. В. (Puzakova L. V.)
  2. Пузаков М. В. (Puzakov M. V.)
  3. Гостюхина О. Л. (Gostyukhina O. L.)
Даты Поступила в редакцию: 20.07.2020
Принята к публикации: 21.01.2021
Опубликована онлайн: 19.02.2021
Абстракт Studying the diversity of energy production pathways is important for understanding the evolutionary relationships between metabolic pathways and their biochemical precursors. The lactate/malate dehydrogenase (LDH/MDH) superfamily has been a model system for structural and functional evolution for a long time. Recently, the type-2 family of LDH/MDH (or LDH2/MDH2 oxidoreductase) has been identified. The LDH2/MDH2 oxidoreductase family is now known to have functionally more diverse enzymes than the LDH/MDH superfamily. In channel catfish, the gene encoding the LDH2/MDH2 oxidoreductase has been found (and was provisionally termed AqE). Homologs of this enzyme are predominantly present in organisms living in an aquatic environment. In this work, we studied the AqE gene distribution among non-tetrapod vertebrates. It was found that the AqE gene is present in the genomes of bony and cartilaginous fish and in the genomes of hagfishes and lampreys. In addition, it has been confirmed that in representatives of Cypriniformes, the AqE gene has been lost. AqE in representatives of Salmoniformes underwent significant deletions, which most likely led to its pseudogenization. In most orders of non-Tetrapoda vertebrates, the AqE gene remains highly conserved, suggesting that the AqE gene in aquatic vertebrates is an essential gene and undergoes rigorous selection. The AqE gene has the highest sequence similarity with the archaeal ComC gene that encodes sulfolactate dehydrogenase (SLDH). Based on the similarity of substrates, the enzyme encoded by the AqE gene is likely involved in the malate–aspartate shuttle mechanism or the biosynthesis of the energy coenzyme M equivalent.
Ключевые слова: gene evolution, gene loss, vertebrates, LDH2/MDH2 oxidoreductase, L-sulfolactate dehydrogenase
Сведения о финансировании, указанные в публикации
URL https://link.springer.com/article/10.1007/s00239-021-09997-x
Дополнительные сведения

Запись создана: 14-05-2021 10:16
Последнее изменение: 09-12-2021 17:34

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Puzakova L. V., Puzakov M. V., Gostyukhina O. L. Newly Discovered AqE Gene is Highly Conserved in Non-tetrapod Vertebrates // Journal of Molecular Evolution. 2021. Vol. 89, iss. 4-5. P. 214-224. https://doi.org/10.1007/s00239-021-09997-x
[WoS 1.821/Q3][SCOPUS 0.591/Q2]
Экспертное заключение: № 54, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.821/Q3 (2019)
Идентификатор
000619382100001
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.591/Q2 (2019)
Идентификатор
2-s2.0-85101235640
РИНЦ
Статус
Нет
ID
46749904
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)