Балл 0
Дата внесения публикации в базу 22-01-2021 09:45 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
КБПР (данная функция работает в тестовом режиме) 0.5
Количество соавторов публикации - 2
Публикации в изданиях, индексируемых в SCOPUS и не индексируемых в Web of Science, K=1
Публикации в изданиях, индексируемых в SCOPUS и не индексируемых в Web of Science, K=1
-
Корнийчук Ю. М.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 1/(2*1) = 0.5
Статья в периодическом издании
Генотипирование черноморских трематод семейства Opecoelidae по митохондриальным маркерам
DOI | https://doi.org/10.21072/mbj.2020.05.4.02 |
---|---|
Язык | Русский |
Журнал | Морской биологический журнал ISSN: 2499-9768; Онлайн ISSN: 2499-9776 |
Год | 2020 |
Выходные данные | Том: 5, Номер: 4, Страницы: 15-27 |
Авторы | |
Даты |
Поступила в редакцию: 01.08.2020 После доработки 18.12.2020 Принята к публикации: 25.12.2020 Опубликована онлайн: 30.12.2020 |
Абстракт | Opecoelidae Ozaki, 1925 (Trematoda: Opecoeloidea) — ведущее по числу видов и родов семейство трематод в Чёрном море. Мариты наиболее распространённых видов черноморских опецелидных трематод подробно описаны морфологически, однако сведения о структуре их геномов отрывочны, а данные о митохондриальных геномах отсутствуют полностью. Цель исследования — получить первые сведения о строении участков митохондриального генома представителей наиболее распространённых в Чёрном море в современный период родов трематод семейства Opecoelidae для последующего уточнения их таксономического статуса. Филогенетические отношения внутри анализируемой части этого семейства реконструированы на основе данных, полученных нами, и соответствующих данных из GenBank с помощью алгоритма Maximum Likelihood и модели нуклеотидных замен HKY. Для укоренения филогенетического дерева использованы соответствующие последовательности Brachycladium goliath (Brachycladioidea: Brachycladiidae). Поскольку последовательности CO1 — стандартного и наиболее популярного митохондриального маркера — для исследуемых родов опецелид до сих пор не были известны, нами на основе известных соответствующих последовательностей Xiphidiata разработаны праймеры для амплификации фрагмента CO1, чтобы впервые провести соответствующий филогенетический анализ. Впервые определены и депонированы в GenBank нуклеотидные последовательности фрагментов митохондриальных генов CO1 и 16S черноморских трематод Cainocreadium flesi Korniychuk & Gaevskaya, 2000, Gaevskajatrema perezi (Mathias, 1926) Gibson & Bray, 1982 и Helicometra fasciata (Rudolphi, 1819) Odhner, 1902 от разных видов дефинитивных хозяев — рыб. У C. flesi не выявлено специфичных к окончательным хозяевам — рыбам линий по структуре фрагмента митохондриального гена CO1, однако отмечено высокое CO1-нуклеотидное разнообразие. У марит черноморских H. fasciata определена приуроченная к зеленушкам-руленам Symphodus tinca CO1-гаплогруппа, статус которой требует дальнейшего выяснения; необходимы экологические и генетические исследования предполагаемого видового комплекса H. fasciata из разных акваторий. При анализе последовательностей фрагмента митохондриального гена 16S рРНК гостальных генетических линий у H. fasciata выделить не удалось. У черноморских G. perezi не обнаружено значительных различий по фрагменту 16S между трематодами из окончательных хозяев разных видов, однако внутривидовое 16S-нуклеотидное разнообразие оказалось высоким. Ключевые слова: Чёрное море, Trematoda, Opecoelidae, Cainocreadium, Gaevskajatrema, Helicometra, митохондриальныегены, CO1, 16SрРНК |
Сведения о финансировании, указанные в публикации | |
URL | https://mbj.marine-research.org/article/view/262 |
Дополнительные сведения |
Запись создана: 22-01-2021 09:45
Последнее изменение: 18-09-2023 13:31
Библиографическая ссылка:
Катохин А. В., Корнийчук Ю. М. Генотипирование черноморских трематод семейства Opecoelidae по митохондриальным маркерам // Морской биологический журнал. 2020. Т. 5, № 4. С. 15-27. https://doi.org/10.21072/mbj.2020.05.4.02
[SCOPUS –/–][РИНЦ 0.487]
Катохин А. В., Корнийчук Ю. М. Генотипирование черноморских трематод семейства Opecoelidae по митохондриальным маркерам // Морской биологический журнал. 2020. Т. 5, № 4. С. 15-27. https://doi.org/10.21072/mbj.2020.05.4.02
[SCOPUS –/–][РИНЦ 0.487]
Экспертное заключение: № 11, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Web of Science
- Статус
- Нет
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- –/– (–)
- Идентификатор
- 2-s2.0-85100432871
В публикации указано госзадание:
№ 121030100028-0 «Закономерности формирования и антропогенная трансформация биоразнообразия и биоресурсов Азово-Черноморского бассейна и других районов Мирового океана» (предыдущий номер АААА-А18-118020890074-2)
Тэги:
ЦКП Коллекция гидробионтов Мирового океана