База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Дата внесения публикации в базу 22-09-2020 13:39 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
Количество соавторов публикации - 6
Публикация не попадает под расчет КБПР
  • Водясова Е. А.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(6*1) = 0
  • Андреева А. Ю.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 0/(6*1) = 0
Тезисы конференции

Genes expression related to the effects of hypoxiain the marine mussel, Mytilus galloprovincialis

DOI https://doi.org/10.18699/BGRS/SB-2020-083
Язык Английский
Конференция BGRS/SB-2020: 11th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology"
Место проведения: Novosibirsk, Russia
Даты проведения: 06–10 July, 2020
Год публикации 2020
Сборник Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020) : Abstracts of the Twelfth International Multiconference, 06–10 July 2020, Novosibirsk, Russia / Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences ; Novosibirsk State University
Выходные данные Novosibirsk : ICG SB RAS, 2020. P. 131-132
Авторы
  1. Водясова E. A. (Vodiasova E.)
  2. Андреева А. Ю. (Andreyeva A.)
  3. Lantushenko A.
    SSU, Sevastopol, Russia (ru)
  4. Meger Ya.
    SSU, Sevastopol, Russia (ru)
  5. Deghtyar I.
    SSU, Sevastopol, Russia (ru)
  6. Afonnikov D.
    ICG SB RAS, Novosibirsk, Russia (ru)
Абстракт Despite that mussel is an important object of mariculture and can play the role of an ecosystem bio-indicator, the study of the effect of hypoxia on these mollusсs is limited only by biochemical and RT-PCR experiments for individual genes (enzymes). There is no data on changes in the expression profile of all genes based on RNA sequencing. At the same time,an understanding of physiological processes requires comprehensive studies based on the study of the expression of all genes in target tissues. At this work, the transcriptomes of the gills of Mytilus galloprovincialis exposed to hypoxic stress (DO 0.3 mg/l) for 24h were sequenced using Illumina technology for the first time. The raw reads assembled into 255,302 transcripts with an N50 value of 1,273 nt. A total of 65 transcripts that differed in abundance in the hypoxia-exposed mussels were identified. Their putative function was assigned using BLAST. The data obtained will allow further large-scale studies for other targeted tissues and to study all aspects of the physiological response of M. galloprovincialis to the emerging oxygen deficiency in the environment.
Ключевые слова: short-time hypoxia, Mytilus galloprovincialis, transcriptomic, differential expression, RNA-seq, comparative analyses
Сведения о финансировании, указанные в публикации
URL
Дополнительные сведения

Запись создана: 22-09-2020 13:39
Последнее изменение: 22-09-2020 13:41

Библиографическая ссылка:
Vodiasova E., Andreyeva A., Lantushenko A., Meger Ya., Deghtyar I., Afonnikov D. Genes expression related to the effects of hypoxiain the marine mussel, Mytilus galloprovincialis // Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020) : Abstracts of the Twelfth International Multiconference, 06–10 July 2020, Novosibirsk, Russia / Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences ; Novosibirsk State University. Novosibirsk : ICG SB RAS, 2020. P. 131-132.
[РИНЦ]
Экспертное заключение: –
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Нет
SCOPUS
Статус
Нет
РИНЦ
Статус
Да
ID
43919465
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)