База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@ibss-ras.ru

Дата внесения публикации в базу 06-02-2020 09:02 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
Количество соавторов публикации - 3
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q4, K=2.5
  • Рылькова О. А.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833
  • Гулин С. Б.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 2.5/(3*1) = 0.833
Статья в периодическом издании

Determination of the Total Microbial Abundance in Black Sea Bottom Sediments Using Flow Cytometry

WoS 1.027/Q4 SCOPUS 0.336/Q3
Перевод
Оригинальная статья:
Определение общей численности микроорганизмов в донных осадках Черного моря методом проточной цитометрии // Микробиология. 2019. Т. 88, № 6. С. 685-694
DOI https://doi.org/10.1134/S0026261719060158
Язык Английский
Журнал Microbiology

ISSN: 0026-2617; Онлайн ISSN: 1608-3237
Год 2019
Выходные данные Том: 88, Выпуск: 6, Страницы: 700-708
Авторы
  1. Рылькова О. А. (Rylkova O. A.)
  2. Гулин С. Б.
    Институт морских биологических исследований имени А. О. Ковалевского РАН
  3. Pimenov N. V.
    Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia (ru)
Даты Поступила в редакцию: 22.05.2019
После доработки 31.05.2019
Принята к публикации: 21.06.2019
Опубликована онлайн: 03.02.2020
Абстракт The known approaches to sample preparation have been improved to achieve a more complete detection of microorganisms of the Black Sea bottom sediments using flow cytometry of SYBR Green I-stained cells. Total microbial abundance in the samples from the shelf and deep-sea sediments varied from 0.03 to 1.54 × 108 cells g–1 and from 0.002 to 1.24 × 108 cells g–1 dry weight, respectively. This is comparable to the data reported previously for various areas of the oceans, including the Black Sea. Application of sodium pyrophosphate was shown to be the most universal method for treating sediments of various types; along with this, using hydrofluoric acid is possible for the deep-sea reduced sediments, whereas treatment with methanol was preferable for the sediments of coastal waters with a normal degree of aeration of the bottom layer. For samples of various types, optimal sample preparation procedures were proposed (choice of chemical reagent, mode of ultrasonic processing and centrifugation, and additional washing procedures). These procedures resulted in significantly more efficient enumeration of bacterial cells, while application of flow cytometry ensured rapid determination of the total number of microorganisms in the bottom sediments.
Ключевые слова: bacteria, microorganisms, bottom sediments, sample preparation methods, microscopy, flow cytometry, fluorochromes, Black Sea
Сведения о финансировании, указанные в публикации
URL
Дополнительные сведения

Запись создана: 06-02-2020 09:02
Последнее изменение: 26-10-2020 16:20

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Rylkova O. A., Gulin S. B., Pimenov N. V. Determination of the Total Microbial Abundance in Black Sea Bottom Sediments Using Flow Cytometry // Microbiology. 2019. Vol. 88, iss. 6. P. 700-708. https://doi.org/10.1134/S0026261719060158
[Перевод][WoS 1.027/Q4][SCOPUS 0.336/Q3]
Экспертное заключение: № 236, 2019
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.027/Q4 (2018)
Идентификатор
000512067800006
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.336/Q3 (2018)
Идентификатор
2-s2.0-85078897671
РИНЦ
Статус
Нет
ID
43243013
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121031500515-8 «Молисмологические и биогеохимические основы гомеостаза морских экосистем» (предыдущий номер АААА-А18-118020890090-2)
№ 121040600178-6 «Структурно-функциональная организация, продуктивность и устойчивость морских пелагических экосистем» (предыдущий номер АААА-А18-118020790229-7)