Балл 0
Дата внесения публикации в базу 15-07-2021 16:21 не попадает в период стимулирования 01-06-2023 – 31-05-2024
КБПР (данная функция работает в тестовом режиме) 5
Количество соавторов публикации - 4
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q2, K=10
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q2, K=10
-
Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 10/(4*1) = 2.5 -
Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 10/(4*1) = 2.5
Статья в периодическом издании
The IS630/Tc1/mariner transposons in three ctenophore genomes
DOI | https://doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107231 |
---|---|
Язык | Английский |
Журнал | Molecular Phylogenetics and Evolution ISSN: 1055-7903; Онлайн ISSN: 1095-9513 |
Год | 2021 |
Выходные данные | Том: 163, Статья: 107231, Страниц (электронный ресурс): 11 |
Авторы | |
Даты |
Поступила в редакцию: 02.02.2021 После доработки 31.05.2021 Принята к публикации: 11.06.2021 Опубликована онлайн: 13.06.2021 |
Абстракт | Transposable elements (TEs) exert a significant effect on the structure and functioning of the genomes and also serve as a source of the new genes. The study of the TE diversity and evolution in different taxa is indispensable for the fundamental understanding of their roles in the genomes. IS630/Tc1/mariner (ITm) transposable elements represent the most prevalent and diverse group of DNA transposons. In this work, we studied the diversity, evolutionary dynamics and the phylogenetic relationships of the ITm transposons found in three ctenophore species: Mnemiopsis leidyi, Pleurobrachia bachei, Beroe ovata. We identified 29 ITm transposons, seven of which possess the terminal inverted repeats (TIRs) and an intact transposase, and, thus, are, presumably, active. Four other ITm transposons have the features of domesticated TEs. According to the results of the phylogenetic analysis, the ITm transposons of the ctenophores represent five groups – MLE/DD34D, TLE/DD34-38E, mosquito/DD37E, Visiror/DD41D and pogo/DDxD. Pogo/DDxD superfamily turnes out to be the most diverse and prevalent, since it accounts for more than 40% of the TEs identified. The data obtained in this research will fill the gap of knowledge of the diversity and evolution of the ITm transposons in the multicellular genomes and will lay the ground for the study of the TE effects on the evolution of the ctenophores. Ключевые слова: IS630/Tc1/mariner , transposable elements, Mnemiopsis leidyi, Pleurobrachia bachei, Beroe ovata, Ctenophores |
Сведения о финансировании, указанные в публикации | |
URL | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790321001640 |
Дополнительные сведения |
Запись создана: 15-07-2021 16:21
Последнее изменение: 15-09-2021 19:30
Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Cheresiz S. V., Sang Y. The IS630/Tc1/mariner transposons in three ctenophore genomes // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2021. Vol. 163. Article no. 107231 (11 p.). https://doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107231
[WoS 4.286/Q2][SCOPUS 1.612/Q1]
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Cheresiz S. V., Sang Y. The IS630/Tc1/mariner transposons in three ctenophore genomes // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2021. Vol. 163. Article no. 107231 (11 p.). https://doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107231
[WoS 4.286/Q2][SCOPUS 1.612/Q1]
Экспертное заключение: № 257, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Web of Science
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 4.286/Q2 (2020)
- Идентификатор
- 000687260600007
- Статус
- Да
- Импакт-фактор/Квартиль(год)
- 1.612/Q1 (2020)
- Идентификатор
- 2-s2.0-85114055541
- Статус
- Нет
- ID
- –
- EDN
- –
В публикации указано госзадание:
№ 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)